净化工程在很多场所都需要，净化工程主要就是对洁净室做一定的控制。通过一定的技术手段，将一定范围内空气中的微粒子、细菌病毒、有害气体等污染物排除出去，同时，对此区域内的洁净度、温度、湿度、气压、风速、噪音、照明灯参数控制在某一个需求范围内。这个工程，就称作净化工程。而净化的这个房间就是洁净室。

现代社会人们对饮食的越关注，就越加重视普通食品饮料质量和增加新鲜食品消费。同时，另一个巨大变化是尽量避免使用添加剂和防腐剂。进行了某种处理而改变了其微生物正常补充的食品特别容易受环境微生物侵蚀。例如，酸牛奶、乳酪和其他奶制品，果汁、加味牛奶和主菜。蘑菇的生长有时也在洁净室里进行以防止条件性病原孢子生长过度。

1、果汁

无菌产品已经占领了单包装（250毫升 ）果汁和饮料市场。这个市场正扩展到其它的产品生产线，包括牛奶饮料、酒、水以及西红柿产品和一公升大包装。

2、奶制品

瑞士的酸牛奶、无菌牛奶或奶酪的加工，以及瑞典的腊肠包装中经常用到无菌处理。

一些大型设施要求100,000级（ISO8和9级）以上。在美国，Jerome乳酪公司在爱达荷州杰罗姆建造了一个3,600万美元，面积140,000 平方英尺的乳酪和乳清产品厂。该厂有4个主要加热和通风系统可输送高达每分钟130,000立方英尺的过滤效率为95％的空气，每小时换气15到20次。车间采用正压，空气从加工区向外流。

3、啤酒、果汁和汽水无菌填装工艺增加了ISO 5级（100级）和ISO 6级（1,000级）洁净室。

传统系统中隧道式巴氏消毒法对产品进行各种高温处理，得到的产品在物理特性上发生变化。相比之下，对受控巴氏消毒法的无菌充装采用较低热处理，可在几方面改进产品的质量。

在啤酒方面，可改进感官特性，例如香气味风格和新鲜度。还可提高多数产品的稳定性，延长储存期。而用于果汁，则避免了象管道巴式消毒法那样受到长时间高温处理，因而没有造成营养损失。结果，香味、口味及颜色等感官性能都得到改善。

4、肉类加工

美国联邦农业部一项研究表明，美国的即食肉制品差不多有5％都感染了单核细胞增多性李氏菌（Listeria monocytogenes），一种可以使人致命的食物传染病菌，可导致败血症、脑膜炎或脑膜脑炎（meningo-encephalitis）——一种影响大脑和脊髓组织的疾病。对于孕妇来说，李氏菌属可引起胚胎夭折和死产。 即食肉制品市场的扩大是增加对洁净室技术需求的一个因素。瑞典是这一领域的先行者。

5、面包房

面包房现在正逐渐接受洁净室技术。日本有许多这种例子。无尘车间净化车间工厂生产几种面包、糖果、大豆豆腐、面条和几种传统的日本食品。

糖果工业采用了生物洁净室技术。新的、越来越复杂的、包装新颖的糖果产品增加了对受控环境的需求（温度、湿度、细菌的水平，等等），以及生产过程的自动化，以便保证良好品质和耐久性。